class: inverse, title-slide, center background-image: url(img/ilyass-seddoug-c4lXkCHuaXY-unsplash.jpg) background-size: cover # Dose resposta #### Análise estatística para a ciência da planta daninha ### Maxwel Coura Oliveira, PhD <br> Weed Scientist <br><br> <a href="https://github.com/maxwelco"><i class="fa fa-github fa-fw"></i> maxwelco</a><br> <a href="https://twitter.com/maxwelco"> <i class="fa fa-twitter fa-fw"></i> @maxwelco</a><br> <a href="https://maxweeds.rbind.io"><i class="fa fa-link fa-fw"></i> maxweeds.rbind.io</a><br> <a href="mailto:maxwelco@gmail.com"><i class="fa fa-paper-plane fa-fw"></i> maxwelco@gmail.com</a><br> .footnote[ ] --- # Curvas <img src="images/curves.png" width="500" style="display: block; margin: auto;" /> --- class: middle left background-image: url(https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/2/25/Aureolus_Theophrastus_Bombastus_von_Hohenheim_%28Paracelsus%29._Wellcome_V0004455.jpg) background-position: right background-size: contain # Dose .blockquote[ "Todas as coisas são venenosas e não são <br> venenosas; apenas a dose torna uma coisa <br> não um venenosa" — Paracelsus (1494 - 1541) ] .footnote[Fonte: Wikipedia] --- # Dose resposta <img src="images/concept_model.png" width="700" style="display: block; margin: auto;" /> --- # Dose resposta <img src="images/dose.png" width="700" style="display: block; margin: auto;" /> .footnote[Keshtkar et al. (2021)] --- # Dose resposta no R - Pacote `drc` ```r #install.packages("drc") library(drc) ``` - Clique aqui para baixar o CRAN: [Package drc](https://cran.r-project.org/web/packages/drc/drc.pdf) - Principais tipos de análises - Dose resposta de herbicidas - Emergeência de plantas daninhas - Período crítico de competição de plantas daninhas --- # Dados - Dose resposta de um estudo investigando resistência à herbicidas - 2 biótipos - 10 doses de mesotrione - Parte dos dados apresentados em Oliveira et al. 2018, [Inheritance of Mesotrione Resistance in an Amaranthus tuberculatus (var. rudis) Population from Nebraska, USA](https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpls.2018.00060/full) <img src="https://pbs.twimg.com/media/C8s5HIPUwAAjGxW.jpg:large" width="250" style="display: block; margin: auto;" /> --- # Dados
--- # Manipulação de dados - Muitas vezes precisamos ajustar os dados antes de iniciar a análise estatística .pull-left[ ![](https://media.giphy.com/media/fxIk8gAC4fHir5s8Su/giphy.gif) ] -- .pull-right[ <img src="https://englelab.gatech.edu/useRguide/images/dplyr_logo.png" width="300" style="display: block; margin: auto;" /> ] --- # Visualização > "O gráfico simples trouxe mais informações à mente do analista de dados do que qualquer outro dispositivo." John Tukey <img src="https://media.giphy.com/media/3oKIPEqDGUULpEU0aQ/giphy.gif" width="500" style="display: block; margin: auto;" /> --- # Modelo - Qual modelo escolher? Existem vários <img src="https://media.giphy.com/media/l1IYkN1bTv8jAAM48/giphy.gif" width="500" style="display: block; margin: auto;" /> --- # Modelo - **Por exemplo**: log-logistico de 4 parâmetro `$$Y = c + \frac{d - c} {1 + exp[b(log x - log e)]}$$` <br> -- | **Parâmetro** | Significado | |:---------------:|:----------------------------:| | b | inclinação | | c | limite inferior | | d | limite superior | | e | ponto de infecção da curva | .footnote[Knezevic et al. (2007)] --- ## Sua vez - Você vai trabalhar com os dados de biomassa - Vá em exercícios --> Dose resposta e faça do número **1 ao 3**. <img src="https://media.giphy.com/media/p4sRGwWBaWGAfBJNos/giphy.gif" width="400" style="display: block; margin: auto;" />
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--- # Interpretando os parâmetros .pull-left[ - Dose efetiva (`ED`): relativa e absoluta ```python ED() ``` - Como comparar as doses efetivas? ```python EDcomp ``` ] .pull-right[ <img src="dose_resposta_files/figure-html/unnamed-chunk-14-1.png" width="500" height="500" style="display: block; margin: auto;" /> ] --- # Sua vez - Você vai trabalhar com os dados de biomassa - Vá em exercícios --> Dose resposta e faça do número **4 ao 5**. <img src="https://media.giphy.com/media/AEHPS520DUgJF8wnon/giphy.gif" style="display: block; margin: auto;" />
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--- # Figura <img src="dose_resposta_files/figure-html/unnamed-chunk-18-1.png" width="500" height="500" style="display: block; margin: auto;" /> --- # Sua vez - Você vai trabalhar com os dados de biomassa - Vá em exercícios --> Dose resposta e faça do número **6**. <img src="https://media.giphy.com/media/55iWgRJB09fCy609aM/giphy.gif" style="display: block; margin: auto;" />
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--- name: goodbye class: right, middle, blue <img style="border-radius: 50%;" src="https://maxweeds.rbind.io/author/avatar_hu907a749d428662ca99fbd9a7b3ed6b04_596633_270x270_fill_q90_lanczos_center.jpg" width="150px"/> # Obrigado! Maxwel Coura Oliveira